19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3659 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3659  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1026    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  31.79 
 
 		 506 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  26.32 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  34.95 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  34.95 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  29.94 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  30.23 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  29.38 
 
 		 497 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  30.51 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  29.94 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  29.47 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  31.11 
 
 		 526 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  27.39 
 
 		 481 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  27.6 
 
 		 497 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  28.21 
 
 		 503 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>