25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0953 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  100 
 
 
495 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  88.48 
 
 
495 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  45.18 
 
 
499 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  44.06 
 
 
499 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  42.57 
 
 
497 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  42.38 
 
 
508 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  42.14 
 
 
496 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
493 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
497 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
483 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  31.59 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  31.34 
 
 
505 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
498 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  24.7 
 
 
506 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  28.96 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.92 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.5 
 
 
513 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  29.03 
 
 
528 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.39 
 
 
512 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  23.77 
 
 
537 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
526 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.2 
 
 
610 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  28.89 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
505 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  25.1 
 
 
475 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>