27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1924 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1011    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  34.11 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  29.17 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  31.66 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  29.27 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  30.65 
 
 		 497 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  30.94 
 
 		 496 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  28.61 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 497 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  27.22 
 
 		 506 aa  93.6  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.46 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.71 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  27.96 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  29.06 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 498 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.89 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3659  hypothetical protein  27 
 
 		 534 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  29.03 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  30.41 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  32.09 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.63 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  29.82 
 
 		 610 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>