20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0917 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  932    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
498 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  29.77 
 
 
496 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  30.09 
 
 
508 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  30.54 
 
 
499 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  30.25 
 
 
505 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  29.97 
 
 
505 aa  99  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  29.07 
 
 
495 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  27.82 
 
 
497 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
493 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  29.95 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  28.97 
 
 
495 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
497 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  28.98 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25.15 
 
 
541 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  27.27 
 
 
535 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25.99 
 
 
610 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  28.42 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  28.19 
 
 
497 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>