31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0954 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  90.98 
 
 
499 aa  906    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
499 aa  988    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  59 
 
 
497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  57.31 
 
 
496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  45.62 
 
 
495 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  45.18 
 
 
495 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 
493 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  41.14 
 
 
508 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
483 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  29.39 
 
 
505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  28.99 
 
 
505 aa  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  25.65 
 
 
506 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  30.58 
 
 
481 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  31.89 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.4 
 
 
513 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.09 
 
 
512 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
526 aa  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  24.63 
 
 
513 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  23.87 
 
 
610 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  26.47 
 
 
541 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  21.71 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  26.07 
 
 
493 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  32.24 
 
 
812 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  26.39 
 
 
527 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
636 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  26.03 
 
 
503 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  24.25 
 
 
537 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  29.09 
 
 
506 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  26.09 
 
 
473 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>