49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3508 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  100 
 
 		 537 aa  1081    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  32.04 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  35.85 
 
 		 507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  28.69 
 
 		 497 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  28.48 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  28.04 
 
 		 597 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  28.97 
 
 		 535 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  25.35 
 
 		 592 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  26.54 
 
 		 541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  26.56 
 
 		 528 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  26.07 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  25.71 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.64 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  24.82 
 
 		 644 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  26.05 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.14 
 
 		 513 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  27.31 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.26 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  24.26 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  25.96 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  24.69 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  23.27 
 
 		 497 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.22 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  23.48 
 
 		 812 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  22.64 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  23.85 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  26.64 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.79 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  25.74 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  24.02 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  24.28 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  24.94 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  23.71 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  24.34 
 
 		 495 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  23.21 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  23.86 
 
 		 499 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.23 
 
 		 864 aa  50.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.15 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  23.91 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  20.87 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  22.37 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  25.58 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 505 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  24.02 
 
 		 544 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>