48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1440 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
483 aa  988    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  31.36 
 
 
499 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 
493 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  29.89 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  30.79 
 
 
508 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  30.89 
 
 
495 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  29.87 
 
 
495 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  30.14 
 
 
497 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  31.09 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  32.92 
 
 
505 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  32.92 
 
 
505 aa  196  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
497 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
498 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  21.85 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  27.07 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  31.58 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
496 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  26.09 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
496 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
497 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  26.06 
 
 
503 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  20.44 
 
 
812 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  25.64 
 
 
597 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3659  hypothetical protein  31.07 
 
 
534 aa  53.5  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
526 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  22.83 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  22.83 
 
 
497 aa  51.6  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  25.13 
 
 
494 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  21.78 
 
 
512 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  24.47 
 
 
534 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.54 
 
 
864 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25.27 
 
 
541 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  26.37 
 
 
583 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  23.22 
 
 
487 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
636 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  23.5 
 
 
497 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  27.1 
 
 
506 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.97 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
548 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.11 
 
 
553 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 
540 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
505 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
548 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
548 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
548 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
548 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  20.79 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>