25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0655 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 493 aa  975    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  42.74 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  42.22 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  41.3 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  43.22 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  41.41 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  41.41 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  37.05 
 
 		 508 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  30.3 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  31.03 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  28.17 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  29.49 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  33.67 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  25.3 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  26.53 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  27.83 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  27.83 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  22.92 
 
 		 513 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  24.11 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3659  hypothetical protein  36 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  24.34 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 526 aa  43.5  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>