24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1104 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  100 
 
 
495 aa  984    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  88.48 
 
 
495 aa  851    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  45.62 
 
 
499 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  44.89 
 
 
499 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  43.17 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  42.17 
 
 
497 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  40.76 
 
 
496 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
493 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
497 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
483 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  31.84 
 
 
505 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  31.59 
 
 
505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
498 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  25.43 
 
 
506 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  30.22 
 
 
481 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  28.8 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  25.9 
 
 
512 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.17 
 
 
513 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.93 
 
 
513 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.55 
 
 
610 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  23.99 
 
 
537 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
526 aa  47.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.96 
 
 
812 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>