28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1107 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
496 aa  982    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  91.13 
 
 
497 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  58.32 
 
 
499 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  57.31 
 
 
499 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  42.14 
 
 
495 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  40.76 
 
 
495 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  41.99 
 
 
493 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  41.82 
 
 
508 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 
497 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  30.88 
 
 
505 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  30.64 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
498 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  24.59 
 
 
506 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  29.15 
 
 
481 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  33.97 
 
 
528 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  24 
 
 
493 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  27.46 
 
 
503 aa  50.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  25.87 
 
 
513 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
526 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  28.41 
 
 
812 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  24.63 
 
 
537 aa  47.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  27.78 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  28.28 
 
 
498 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  29.17 
 
 
610 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  25.43 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
520 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.3 
 
 
512 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>