26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5017 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 497 aa  982    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  40.2 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  40.04 
 
 		 499 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  39.38 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  38.32 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  37.11 
 
 		 497 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  38.57 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  36.31 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  28.19 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.95 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  26.46 
 
 		 506 aa  91.3  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  30.5 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  30.84 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.19 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  23.96 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  27.61 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  24.49 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  27.1 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  29.34 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  24.08 
 
 		 513 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  29.31 
 
 		 480 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>