58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0550 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  77.24 
 
 		 493 aa  784    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  100 
 
 		 503 aa  1008    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  33.6 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  23.41 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  25.06 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 553 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.92 
 
 		 582 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.02 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  27.84 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  27.31 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  23.49 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  24.88 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  29.79 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.23 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  28.78 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  26.43 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  21.88 
 
 		 512 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  22.69 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  30.08 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  25.98 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  28.24 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  22.97 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  31.19 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  31.19 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  28.24 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  24.18 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.32 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  29.34 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.43 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.56 
 
 		 528 aa  57  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  27.06 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.3 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  27.04 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25.61 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  24.24 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 520 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  21.35 
 
 		 596 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  25.87 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  23.2 
 
 		 502 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  28.31 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  25.82 
 
 		 611 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  23.71 
 
 		 622 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  26.57 
 
 		 489 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 476 aa  43.5  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>