72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1646 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  67.34 
 
 		 494 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  67.94 
 
 		 497 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 496 aa  980    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  67.95 
 
 		 496 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  67.75 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  62.88 
 
 		 498 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  61.32 
 
 		 498 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  57.42 
 
 		 513 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  36.81 
 
 		 488 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  42.14 
 
 		 476 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  30.1 
 
 		 582 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  28.01 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  41.44 
 
 		 636 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  25.44 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  39.51 
 
 		 505 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.56 
 
 		 864 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 528 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  32.47 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.86 
 
 		 496 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.29 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  37.7 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  39.2 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  33.22 
 
 		 498 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  32.55 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  28.42 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  25.08 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  30.21 
 
 		 527 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.91 
 
 		 557 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 526 aa  93.2  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  28.07 
 
 		 812 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  28.76 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.64 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  28.62 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  29.91 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  32.8 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  33.12 
 
 		 490 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  30.87 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  25.41 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  25.56 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  31.51 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.42 
 
 		 528 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  27.73 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.49 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  29.39 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  26.09 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  30.53 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  27.44 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  27.44 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  27.97 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  25.44 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  28.18 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  25.69 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  26.79 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  27.5 
 
 		 503 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  32.14 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  21.9 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3074  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0020891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  22.09 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  24.82 
 
 		 540 aa  47  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25.68 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  21.58 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  29.49 
 
 		 527 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.37 
 
 		 610 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 		 503 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>