48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4028 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  78.42 
 
 		 516 aa  804    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 520 aa  1053    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  31.11 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  29.01 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  35.59 
 
 		 498 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.48 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  27.74 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  26.76 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.27 
 
 		 557 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 636 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  26.73 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  27.91 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.88 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  28.92 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.8 
 
 		 864 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  30.66 
 
 		 527 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  26.32 
 
 		 582 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  44.59 
 
 		 505 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 498 aa  53.9  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.46 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  26.94 
 
 		 550 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  24.14 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  26.94 
 
 		 550 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  25.35 
 
 		 461 aa  50.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  48.84 
 
 		 526 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.89 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  26.42 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  25.16 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.52 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  22.25 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  39.71 
 
 		 498 aa  47  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.01 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  30.22 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.86 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  23.05 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  32.14 
 
 		 655 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.72 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  34.93 
 
 		 561 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.37 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  30.99 
 
 		 473 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>