48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2629 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  940    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  44.29 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  47.57 
 
 		 506 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  38.31 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  44.47 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  35.85 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  45.29 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  29.61 
 
 		 526 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 518 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  36.51 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  34.02 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  38.83 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  34.58 
 
 		 509 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  24.64 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.76 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  37.73 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  30.74 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.93 
 
 		 505 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.38 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.62 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  36.9 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  23.01 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  26.59 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.8 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.17 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  30.08 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  27.57 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25.88 
 
 		 610 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.73 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  26.24 
 
 		 527 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.5 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  28 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.43 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  22.89 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  26.44 
 
 		 497 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  25 
 
 		 583 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  26.44 
 
 		 497 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  21.92 
 
 		 513 aa  43.9  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>