59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2024 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1074    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
518 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  36.71 
 
 
527 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  30.71 
 
 
489 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  35.7 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
503 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  30.22 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  34.69 
 
 
509 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
502 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  30.85 
 
 
490 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  29.82 
 
 
492 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  29.43 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  29.77 
 
 
510 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  29.35 
 
 
500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  26.21 
 
 
504 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  27.25 
 
 
525 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  34.07 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  47 
 
 
509 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  28.69 
 
 
498 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  31.33 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  28.24 
 
 
493 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  28.89 
 
 
582 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  25.74 
 
 
509 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
496 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
636 aa  65.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.03 
 
 
461 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
496 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
526 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  25.71 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  30.07 
 
 
812 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.32 
 
 
557 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  26.53 
 
 
527 aa  60.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  29.55 
 
 
506 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
497 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.57 
 
 
461 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.14 
 
 
494 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
498 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  21.35 
 
 
487 aa  54.3  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  22.83 
 
 
465 aa  54.3  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
564 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  31.85 
 
 
505 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  26.15 
 
 
513 aa  51.2  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 
520 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  24.73 
 
 
475 aa  50.4  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.27 
 
 
505 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.27 
 
 
505 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.17 
 
 
864 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  27.18 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.88 
 
 
496 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  27.18 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 
516 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.35 
 
 
488 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.43 
 
 
505 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  23.29 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.57 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  24.8 
 
 
512 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  26.82 
 
 
503 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
513 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>