14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4134 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  45.32 
 
 
500 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  34.78 
 
 
489 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  36.14 
 
 
506 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  30.38 
 
 
492 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  33.57 
 
 
525 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  29.43 
 
 
504 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  31.33 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  38.19 
 
 
570 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  37.24 
 
 
490 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
518 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  38.18 
 
 
509 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
503 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  39.73 
 
 
527 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>