31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  979    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  43.12 
 
 		 504 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  37.12 
 
 		 500 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  39.88 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  34.97 
 
 		 489 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  34.41 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  29.82 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  35.53 
 
 		 525 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  31.52 
 
 		 570 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  31.35 
 
 		 292 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.63 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  30.15 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  27.56 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  23.88 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  35 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  52.46 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  26.7 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  24.54 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  22.46 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  21.36 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  19.69 
 
 		 487 aa  47  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.48 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  23.76 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 553 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  24.24 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  21.62 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>