49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0408 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  94.89 
 
 
509 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  93.32 
 
 
509 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  949    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  67.08 
 
 
527 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  35.39 
 
 
526 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
518 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  34.85 
 
 
489 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  36.91 
 
 
506 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  35.51 
 
 
500 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  32.32 
 
 
504 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  29.61 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  33.68 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  33.04 
 
 
490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.19 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
502 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  27.52 
 
 
502 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  34.77 
 
 
570 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  39.49 
 
 
292 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  36.92 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  30.95 
 
 
582 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
496 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  34.1 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  34.1 
 
 
505 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  30.23 
 
 
494 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  36.84 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.57 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  32 
 
 
527 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  30.09 
 
 
506 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
496 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
636 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.97 
 
 
496 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.77 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
498 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  21.8 
 
 
557 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.24 
 
 
505 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.34 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.62 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  30.77 
 
 
611 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  31.19 
 
 
498 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
526 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  31.44 
 
 
498 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  28.35 
 
 
597 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  29.07 
 
 
505 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.03 
 
 
461 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  23.76 
 
 
513 aa  43.5  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>