30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3570 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1004    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  39.32 
 
 
489 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  40.9 
 
 
506 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  44.15 
 
 
500 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  35.6 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  27.97 
 
 
526 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  31.63 
 
 
504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  33.53 
 
 
490 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  30.74 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  33.93 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  32.58 
 
 
527 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.16 
 
 
510 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
502 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
503 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  32.02 
 
 
509 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  33.2 
 
 
509 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  23.44 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.76 
 
 
465 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  26.02 
 
 
498 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  22.61 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  21.08 
 
 
513 aa  45.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.9 
 
 
509 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  25 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  26.67 
 
 
497 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  26.67 
 
 
497 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
496 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.86 
 
 
610 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  26.81 
 
 
506 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
553 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>