27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3980 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  997    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  43.75 
 
 		 492 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  35.31 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  37.79 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  32.91 
 
 		 489 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  32.22 
 
 		 506 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  26.6 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  31.84 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  32.11 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  31.41 
 
 		 570 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.5 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.05 
 
 		 510 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  29.03 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  29.45 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  22.96 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 496 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  22.87 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 496 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  39.34 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  22.43 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  39.34 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  27.52 
 
 		 622 aa  43.9  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>