38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2186 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
502 aa  1021    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  63.55 
 
 
502 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  56.94 
 
 
503 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  48.62 
 
 
510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  31.13 
 
 
526 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
518 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  28.13 
 
 
489 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  28.36 
 
 
506 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  28.24 
 
 
500 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  26.9 
 
 
504 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  29.6 
 
 
527 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  27.41 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  29.57 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  26.01 
 
 
492 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  23.57 
 
 
465 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.82 
 
 
557 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.85 
 
 
461 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  28.38 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  25.09 
 
 
490 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  26.24 
 
 
498 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  22.84 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  28.37 
 
 
570 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  25.78 
 
 
493 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
636 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  22.98 
 
 
513 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
496 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  24.9 
 
 
475 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 
497 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  21.53 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
526 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.68 
 
 
531 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  24.53 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  25.43 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  25.86 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.32 
 
 
864 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  30.2 
 
 
292 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  25.86 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  26.74 
 
 
611 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>