66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1026 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  100 
 
 
557 aa  1147    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  26.74 
 
 
465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  26.3 
 
 
487 aa  95.9  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
496 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  33.66 
 
 
550 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  33.66 
 
 
550 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
497 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  32.14 
 
 
513 aa  90.1  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
498 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
496 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  23.57 
 
 
512 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.24 
 
 
864 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  26.62 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.62 
 
 
582 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.12 
 
 
506 aa  84  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.03 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
636 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  25.4 
 
 
527 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
553 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  26.32 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  26.06 
 
 
498 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  28.64 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.93 
 
 
531 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  27.36 
 
 
505 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  24.34 
 
 
622 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  30.41 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  23.86 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  23.23 
 
 
506 aa  70.5  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  24.56 
 
 
473 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.16 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
520 aa  67  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  25.2 
 
 
480 aa  67  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  26.05 
 
 
520 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.38 
 
 
502 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  24.55 
 
 
615 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  24.55 
 
 
615 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  24.46 
 
 
611 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.09 
 
 
812 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  27.94 
 
 
493 aa  63.5  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.58 
 
 
528 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
476 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  26.32 
 
 
526 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.41 
 
 
518 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  23.04 
 
 
535 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.85 
 
 
496 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
502 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
502 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.49 
 
 
505 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  23.98 
 
 
503 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
505 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.6 
 
 
502 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  25 
 
 
583 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
503 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  24.88 
 
 
541 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  20.72 
 
 
489 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  25.27 
 
 
503 aa  47.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  21.12 
 
 
528 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  20.56 
 
 
596 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.64 
 
 
610 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  22.22 
 
 
513 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>