53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1008 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  988    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  33.13 
 
 
490 aa  279  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
516 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  27.9 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.43 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  29.06 
 
 
513 aa  67.8  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
497 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  33.96 
 
 
498 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  28.05 
 
 
812 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  33.64 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  26.58 
 
 
582 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  37.5 
 
 
496 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
636 aa  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  27.27 
 
 
512 aa  63.9  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
553 aa  63.9  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  24.31 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.51 
 
 
505 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
476 aa  61.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  28.74 
 
 
505 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
526 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  26.75 
 
 
493 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  29.21 
 
 
494 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  27.42 
 
 
527 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.11 
 
 
864 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  29.05 
 
 
550 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  29.05 
 
 
550 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  28.51 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  28.7 
 
 
503 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.94 
 
 
488 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  26.87 
 
 
461 aa  57.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
498 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.35 
 
 
557 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  30.1 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.96 
 
 
502 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.08 
 
 
531 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  33.33 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  32.09 
 
 
473 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  26.87 
 
 
461 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
513 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  32.59 
 
 
480 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
502 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.07 
 
 
528 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  27.62 
 
 
520 aa  47.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  30.41 
 
 
498 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.96 
 
 
505 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  28.84 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  31.33 
 
 
506 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  27.57 
 
 
611 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  30.77 
 
 
490 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>