63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1743 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  100 
 
 
513 aa  1036    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  34.13 
 
 
493 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  33.73 
 
 
503 aa  236  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  25.6 
 
 
465 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  23.6 
 
 
487 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
553 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
505 aa  106  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  31.16 
 
 
582 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  31.56 
 
 
509 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.25 
 
 
557 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  27.22 
 
 
520 aa  97.1  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  27.57 
 
 
527 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
496 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  29.55 
 
 
494 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  25.68 
 
 
506 aa  87.4  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
496 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.18 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  31.37 
 
 
550 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  31.37 
 
 
550 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.53 
 
 
488 aa  77.8  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
516 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  23.8 
 
 
812 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  21.97 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
498 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.67 
 
 
528 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  23.43 
 
 
512 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
636 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.74 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  28.89 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  22.81 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  30.73 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  29.05 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.29 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.5 
 
 
864 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  23.44 
 
 
473 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  24.16 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  29.06 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  22.11 
 
 
490 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.24 
 
 
496 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  28.76 
 
 
622 aa  63.9  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.77 
 
 
502 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
526 aa  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
520 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  25.87 
 
 
489 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  23.68 
 
 
461 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.34 
 
 
528 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.42 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
513 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
476 aa  57.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  28.79 
 
 
480 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 
503 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  26.29 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.08 
 
 
596 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  25.54 
 
 
611 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  26.15 
 
 
526 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  23.39 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  23.39 
 
 
497 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  25.57 
 
 
506 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  24.39 
 
 
527 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  23.72 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  32.71 
 
 
497 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>