42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0592 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 516 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  66.4 
 
 		 513 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  65.87 
 
 		 513 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  64.65 
 
 		 512 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  33.4 
 
 		 583 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  34.14 
 
 		 544 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  28.12 
 
 		 541 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  27.93 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  27.29 
 
 		 535 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25.68 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  27.07 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  27.07 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  30.32 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  29.07 
 
 		 597 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  26.47 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.4 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.48 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  31.09 
 
 		 505 aa  67  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.66 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  22.4 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  30.57 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  21.67 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  22.27 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.19 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.72 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  32.27 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  25.37 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  29.49 
 
 		 498 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  24.6 
 
 		 475 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  25 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  25.28 
 
 		 592 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.13 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.35 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.73 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  24.88 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  24.62 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  28.21 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25.76 
 
 		 557 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  23 
 
 		 510 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.34 
 
 		 488 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>