22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2397 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  71.54 
 
 		 592 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  100 
 
 		 641 aa  1240    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  73.58 
 
 		 644 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  53.23 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  26.11 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  26.11 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  28.63 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  28.49 
 
 		 502 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  27.71 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  26.53 
 
 		 502 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  31.16 
 
 		 507 aa  97.8  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.36 
 
 		 537 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  26.65 
 
 		 522 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  27.12 
 
 		 503 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.05 
 
 		 610 aa  81.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  29.88 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  29.2 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  23.81 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  25.99 
 
 		 512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.37 
 
 		 513 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  26.22 
 
 		 513 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  24.88 
 
 		 534 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>