21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2597 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1004    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  81.71 
 
 
502 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  61.19 
 
 
502 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  60.72 
 
 
528 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  60.88 
 
 
502 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  57.71 
 
 
502 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  62.07 
 
 
503 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  27.92 
 
 
597 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  26.18 
 
 
592 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.11 
 
 
537 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  22.84 
 
 
497 aa  93.6  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  22.84 
 
 
497 aa  93.2  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.28 
 
 
507 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  30.8 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  31.84 
 
 
641 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  22.13 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  25.55 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25 
 
 
541 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  25.88 
 
 
510 aa  47.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  27.27 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  90.91 
 
 
380 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>