20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4360 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  69.18 
 
 		 528 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  70.58 
 
 		 502 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  68 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  65.4 
 
 		 502 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  61.88 
 
 		 522 aa  522  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  61.2 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  28.85 
 
 		 592 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  27.41 
 
 		 597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  27.45 
 
 		 644 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.91 
 
 		 537 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  26.9 
 
 		 641 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  23.57 
 
 		 497 aa  97.8  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  23.57 
 
 		 497 aa  97.4  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  21.19 
 
 		 610 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27.66 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 636 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.42 
 
 		 864 aa  53.9  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  23.89 
 
 		 535 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  27.23 
 
 		 541 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>