More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0429 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
690 aa  1405    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
680 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
693 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
712 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
688 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
659 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
694 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
684 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
694 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
688 aa  286  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  28.37 
 
 
704 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  29.91 
 
 
689 aa  277  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
703 aa  262  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
675 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
711 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  29.37 
 
 
677 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
672 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
688 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
706 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  26.64 
 
 
696 aa  204  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  27.59 
 
 
677 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
690 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
681 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
690 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
697 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  28.41 
 
 
684 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
686 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 
701 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
678 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
1275 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.71 
 
 
1016 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
504 aa  84  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1453  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.23 
 
 
491 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
809 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  27.46 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1523  histidine kinase  23.31 
 
 
437 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
1022 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
857 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 
702 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.52 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  28.92 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 
1519 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
998 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
899 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
618 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.76 
 
 
551 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.92 
 
 
525 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
710 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  25.21 
 
 
764 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 
525 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  26.83 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.77 
 
 
661 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
720 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
721 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
707 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 
766 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.98 
 
 
684 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
704 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
943 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.1 
 
 
661 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
708 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
693 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 
619 aa  78.2  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 
944 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  23.98 
 
 
684 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
713 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
1415 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 
785 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
586 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
705 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.37 
 
 
905 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
594 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  27.83 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.35 
 
 
581 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  29.39 
 
 
956 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 
1419 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
1527 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
853 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
672 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
662 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
946 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  25.45 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  24.67 
 
 
617 aa  75.1  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  24.82 
 
 
1000 aa  75.1  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  35.46 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 
680 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
942 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
576 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  25 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 
1014 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
1029 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
686 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  25.21 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>