More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2439 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  47.57 
 
 		 696 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.3 
 
 		 695 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 690 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 690 aa  1407    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 681 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  45.07 
 
 		 677 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  40.35 
 
 		 684 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 701 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 686 aa  362  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 678 aa  360  7e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 703 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 688 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 704 aa  257  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  31.18 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 693 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 694 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 684 aa  239  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 688 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 688 aa  234  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 711 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 680 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 708 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 672 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 677 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 659 aa  208  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 690 aa  205  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 706 aa  185  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 697 aa  180  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  24.9 
 
 		 675 aa  178  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 694 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 802 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 671 aa  98.6  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.54 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.74 
 
 		 611 aa  94.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 586 aa  94  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 1338 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 722 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  33.33 
 
 		 506 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.6 
 
 		 538 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 689 aa  92  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0423  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.03 
 
 		 498 aa  92  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5559  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.7 
 
 		 752 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 501 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 635 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  28.63 
 
 		 458 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  30.26 
 
 		 1710 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0488  histidine kinase  28.86 
 
 		 250 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  28.57 
 
 		 617 aa  91.3  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  28.63 
 
 		 458 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 509 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 499 aa  90.9  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 1744 aa  90.9  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  31.09 
 
 		 620 aa  90.9  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 367 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  25.91 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  25.91 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 630 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2407  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 662 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  25.91 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 519 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  28.19 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  28.19 
 
 		 465 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 595 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 595 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 632 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 870 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 492 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 632 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 632 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  25.88 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 526 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  32 
 
 		 500 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 648 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 525 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.16 
 
 		 492 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 416 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 489 aa  88.2  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 566 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 943 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 654 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  25.88 
 
 		 465 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  25.88 
 
 		 465 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  25.88 
 
 		 465 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  25.88 
 
 		 465 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  28.95 
 
 		 600 aa  87.8  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  28.19 
 
 		 458 aa  87.4  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.67 
 
 		 1836 aa  87.8  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 642 aa  87.4  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  25.2 
 
 		 590 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  28.84 
 
 		 638 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 367 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.66 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  27.65 
 
 		 630 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  25.2 
 
 		 595 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 557 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 565 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 733 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>