More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0488 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0488  histidine kinase  100 
 
 		 250 aa  500  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  55.37 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  55.6 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  53.78 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 557 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  34.73 
 
 		 591 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 655 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  37.22 
 
 		 1092 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 556 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  37.6 
 
 		 567 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  34.17 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 656 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  37.61 
 
 		 656 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  39.67 
 
 		 483 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 577 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 584 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 510 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 804 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  38.05 
 
 		 516 aa  138  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 551 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 588 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 655 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 495 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.57 
 
 		 819 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 565 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 566 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 552 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 557 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 852 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 552 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  38.79 
 
 		 548 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 801 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  36.97 
 
 		 587 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 853 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 655 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 		 541 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 548 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 819 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  35.37 
 
 		 592 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 592 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 576 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  34.9 
 
 		 542 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.52 
 
 		 1255 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 548 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 756 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 607 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 852 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 552 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 560 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 970 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 576 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  33.76 
 
 		 801 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  33.04 
 
 		 647 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 408 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 552 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  36.97 
 
 		 621 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  34.19 
 
 		 501 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 1062 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  38.33 
 
 		 458 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  35.5 
 
 		 672 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 522 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  35.47 
 
 		 571 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 523 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  34.68 
 
 		 554 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 523 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  35.19 
 
 		 912 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  38.6 
 
 		 458 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 542 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 504 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 842 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 570 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 658 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 488 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 1131 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  37.77 
 
 		 560 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 494 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 844 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 364 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.44 
 
 		 458 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 402 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  35.29 
 
 		 887 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 1061 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.19 
 
 		 457 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  37.89 
 
 		 458 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  37.44 
 
 		 465 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 672 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  35.42 
 
 		 465 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 520 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0246  histidine kinase  32.76 
 
 		 473 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.44 
 
 		 458 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  34.16 
 
 		 552 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  37.29 
 
 		 830 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  37.07 
 
 		 517 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  37 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  32.93 
 
 		 587 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 861 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 570 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 737 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1415 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>