More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2196 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  100 
 
 
684 aa  1376    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  44.14 
 
 
696 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
681 aa  512  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  43.06 
 
 
677 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
695 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
690 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
701 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
690 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
678 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
693 aa  230  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
688 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  31.5 
 
 
689 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
680 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
684 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
688 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
659 aa  196  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
703 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
694 aa  194  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  28.68 
 
 
704 aa  193  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
688 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
711 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
712 aa  180  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 
694 aa  179  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
672 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
690 aa  177  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
675 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
697 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  26.01 
 
 
677 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
708 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
706 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  29.13 
 
 
611 aa  97.4  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.76 
 
 
598 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
855 aa  92.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.9 
 
 
547 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
671 aa  91.3  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
463 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.3 
 
 
747 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  27.73 
 
 
496 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.95 
 
 
747 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
378 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.95 
 
 
747 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
525 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
525 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
729 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  27.67 
 
 
674 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
364 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  30.53 
 
 
465 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
503 aa  87.4  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  30.67 
 
 
458 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  30.53 
 
 
465 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  28.29 
 
 
369 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
630 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  30.53 
 
 
465 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.31 
 
 
492 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  30.67 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  30.22 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  29.44 
 
 
1084 aa  86.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
592 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.22 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  30.09 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  29.29 
 
 
623 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  30.22 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  29.91 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  30.22 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  28.63 
 
 
617 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  30.22 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.63 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  29.65 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
755 aa  84  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.25 
 
 
541 aa  84  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  29.78 
 
 
465 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
484 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
566 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
654 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
512 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
720 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  30.04 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
733 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
738 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  27.66 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
542 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
729 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  30.04 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
438 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
850 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
595 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
524 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.98 
 
 
1710 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  28.74 
 
 
630 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
635 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  25.75 
 
 
611 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1222 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
857 aa  81.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>