More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2325 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  51.16 
 
 		 677 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 681 aa  1397    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  53.02 
 
 		 696 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 690 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 695 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 690 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  44.61 
 
 		 684 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 701 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 686 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 678 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  29.5 
 
 		 689 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 703 aa  251  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  29.42 
 
 		 704 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 693 aa  247  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 688 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 659 aa  233  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 694 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 684 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 680 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 712 aa  218  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 672 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 688 aa  209  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 690 aa  203  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 677 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 711 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 675 aa  186  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 697 aa  174  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 694 aa  169  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 706 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.16 
 
 		 611 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  29.96 
 
 		 621 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 689 aa  107  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.04 
 
 		 598 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  29.57 
 
 		 614 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 367 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 492 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  33.48 
 
 		 830 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  32.76 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  28.95 
 
 		 656 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 826 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 559 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 742 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  26.64 
 
 		 595 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 590 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 1018 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  32.19 
 
 		 647 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 943 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1036 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 885 aa  98.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 458 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 798 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  32.47 
 
 		 623 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 458 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 500 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 367 aa  97.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 458 aa  97.4  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  31.05 
 
 		 655 aa  97.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 525 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 510 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  32.76 
 
 		 465 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  28.63 
 
 		 630 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 798 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 794 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 595 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  32.17 
 
 		 458 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 703 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 525 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 		 1016 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  27.95 
 
 		 595 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  29.87 
 
 		 635 aa  95.5  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00243  two-component VirA-like sensor kinase  30.54 
 
 		 810 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 591 aa  95.1  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 601 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 946 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  28.99 
 
 		 367 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 818 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  29.83 
 
 		 600 aa  94.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  32.33 
 
 		 458 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.35 
 
 		 517 aa  94.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 		 1021 aa  94  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 438 aa  94  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  25.82 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  25.82 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  30.36 
 
 		 829 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  25.82 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 355 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 494 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 795 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  28.38 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 390 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1050 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>