More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1993 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  60.7 
 
 		 677 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  100 
 
 		 696 aa  1419    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.02 
 
 		 681 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 690 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 		 695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 690 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  45.23 
 
 		 684 aa  482  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 678 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  29.78 
 
 		 704 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 693 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 659 aa  242  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 694 aa  241  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 688 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 703 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  28.34 
 
 		 689 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 712 aa  223  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 711 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 680 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 688 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 684 aa  211  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 688 aa  210  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 690 aa  201  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 708 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 672 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  27.41 
 
 		 675 aa  193  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  27.21 
 
 		 677 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 694 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 697 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 706 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.23 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.39 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 689 aa  105  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.57 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 677 aa  104  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  32.19 
 
 		 367 aa  103  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  27.74 
 
 		 621 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  31.13 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 826 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 885 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 1744 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 798 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 944 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 525 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  31.92 
 
 		 550 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 899 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 720 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  30.47 
 
 		 638 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 679 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 946 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 1415 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  29.91 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.76 
 
 		 541 aa  99.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  29.91 
 
 		 458 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.27 
 
 		 542 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  30.99 
 
 		 779 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 581 aa  99  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 1054 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 798 aa  98.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 693 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  29.91 
 
 		 458 aa  98.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 680 aa  97.8  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  30.53 
 
 		 465 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  29.46 
 
 		 458 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 943 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  28.05 
 
 		 496 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 516 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  30.47 
 
 		 600 aa  97.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  28.05 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 378 aa  96.3  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  30.53 
 
 		 458 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 748 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1014 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.95 
 
 		 608 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.95 
 
 		 608 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.95 
 
 		 608 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 766 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 785 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.95 
 
 		 608 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 398 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.95 
 
 		 608 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 770 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 752 aa  95.1  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  28.02 
 
 		 611 aa  95.1  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 542 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 489 aa  95.1  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 		 794 aa  94.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 703 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 736 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 742 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 755 aa  94  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 764 aa  94  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 367 aa  94  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  31.56 
 
 		 830 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1465 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  29.41 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>