More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4277 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4277  ABC transporter related  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0483336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2685  ABC transporter related  46.12 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6496  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0021412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1277  ABC transporter related  44.39 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1035  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  39 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  29.9 
 
 		 316 aa  96.3  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  31.79 
 
 		 336 aa  95.9  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  33.16 
 
 		 299 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  30.95 
 
 		 302 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 		 299 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  32.52 
 
 		 299 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  33.73 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  31.5 
 
 		 302 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  32.2 
 
 		 332 aa  92  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.38 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  34.38 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  30.05 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1484  ABC transporter related  34.03 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.38 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.37 
 
 		 323 aa  91.3  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  34.94 
 
 		 273 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0247  ABC transporter related  31.55 
 
 		 299 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.702234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0931  ABC transporter related  31.66 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0622684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 309 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 310 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4435  heme exporter protein CcmA  30.2 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2717  ABC transporter related  29.65 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  30.41 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  32.02 
 
 		 323 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 305 aa  89  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.38 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  28.42 
 
 		 309 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  30.58 
 
 		 294 aa  88.2  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  32.02 
 
 		 320 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  31.02 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  34.3 
 
 		 286 aa  87.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  28.14 
 
 		 284 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  29.67 
 
 		 305 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0122  ABC transporter related  33.33 
 
 		 250 aa  85.9  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.102502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  31.53 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.03 
 
 		 368 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  27.41 
 
 		 296 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  28.86 
 
 		 328 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.78 
 
 		 312 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  31.58 
 
 		 305 aa  85.5  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 		 301 aa  85.5  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  31.86 
 
 		 309 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.9 
 
 		 328 aa  85.1  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0219  ABC transporter related  31.21 
 
 		 317 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.106594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  34.59 
 
 		 324 aa  85.1  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  34.5 
 
 		 334 aa  85.1  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.25 
 
 		 317 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  29.12 
 
 		 346 aa  84.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 314 aa  85.1  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 351 aa  84.7  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 319 aa  84.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  29.07 
 
 		 293 aa  84.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.88 
 
 		 329 aa  84.7  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  30.23 
 
 		 409 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  29.38 
 
 		 303 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  31.82 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  31.12 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2967  ABC transporter related  30 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  31.03 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  25.85 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  31.03 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  30 
 
 		 876 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1464  ABC transporter-related protein  32.62 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  30.54 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  30.52 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0680  heme exporter protein CcmA  27.86 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  30.41 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.72 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  29.17 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  27.05 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  31.4 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1424  ATPase  30.93 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0734659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.02 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  30.99 
 
 		 897 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  30.41 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  29.76 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  32.26 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0966  ABC transporter related  34.43 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1302  ABC transporter related  29.02 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  31.98 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  28.26 
 
 		 533 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  30.61 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1162  ABC transporter related  32.6 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426993  normal  0.26857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  27.62 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  29.13 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>