More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2685 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2685  ABC transporter related  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6496  ABC transporter related protein  51.94 
 
 		 208 aa  230  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0021412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4277  ABC transporter related  46.12 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0483336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1277  ABC transporter related  43.2 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1035  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  33.97 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  31.25 
 
 		 300 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 300 aa  98.6  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 		 300 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 		 300 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.73 
 
 		 328 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 300 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 		 327 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 		 300 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 300 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.71 
 
 		 329 aa  95.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  29.19 
 
 		 310 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 		 248 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.62 
 
 		 323 aa  93.2  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  29.06 
 
 		 310 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  30.14 
 
 		 317 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  28.71 
 
 		 319 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  29.13 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 319 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  27.09 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2717  ABC transporter related  28.78 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  29.41 
 
 		 249 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.98 
 
 		 331 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  27.98 
 
 		 331 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  29.05 
 
 		 311 aa  89  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  26.47 
 
 		 251 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  28.24 
 
 		 303 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  28.24 
 
 		 303 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  27.31 
 
 		 303 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  31.91 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  28.14 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  28.49 
 
 		 309 aa  87.8  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  34.13 
 
 		 356 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  26.85 
 
 		 303 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  27.23 
 
 		 299 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  25.96 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  26.61 
 
 		 303 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  29.59 
 
 		 304 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  27.52 
 
 		 331 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.32 
 
 		 324 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4435  heme exporter protein CcmA  25.73 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  29.59 
 
 		 326 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.29 
 
 		 328 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  27.23 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 		 310 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.8 
 
 		 328 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  30.15 
 
 		 322 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  29.47 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  30.57 
 
 		 345 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  29.47 
 
 		 302 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  28.35 
 
 		 335 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.84 
 
 		 360 aa  85.1  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  29.02 
 
 		 305 aa  85.5  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  32 
 
 		 299 aa  85.1  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  24.04 
 
 		 308 aa  85.1  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0934  heme exporter protein CcmA  29.7 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  31.79 
 
 		 305 aa  84.7  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.19 
 
 		 324 aa  84.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  29.38 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  28.29 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  26.73 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  28.92 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  28.44 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  26.83 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  28.57 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.78 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  27.09 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  30.64 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  31.21 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  29.63 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0676  ABC transporter related  28.08 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.620401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  30.64 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  30.43 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.15 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1495  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.29 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2582  ABC transporter related  26.57 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  28.57 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  29.69 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  26.79 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  29.41 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>