More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3354 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
249 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2582  ABC transporter related  45 
 
 
237 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  37.8 
 
 
266 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07660  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.79 
 
 
237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.771669  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05000  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.58 
 
 
256 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.977255  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.73 
 
 
314 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.76 
 
 
290 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  38.14 
 
 
325 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  40.55 
 
 
297 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 
316 aa  139  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
339 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 
325 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.93 
 
 
322 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.4 
 
 
327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0424  ABC transporter related  38.64 
 
 
316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  41.98 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  30.23 
 
 
240 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 
327 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.87 
 
 
343 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
274 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.26 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 
321 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41.4 
 
 
303 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  41.18 
 
 
287 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  36.23 
 
 
331 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.4 
 
 
332 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.26 
 
 
328 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.04 
 
 
279 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  40.58 
 
 
344 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  38.6 
 
 
303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  37.44 
 
 
340 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  35.05 
 
 
288 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 
332 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.79 
 
 
309 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  30.95 
 
 
310 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
301 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.86 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.85 
 
 
293 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  36.36 
 
 
314 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 
348 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.72 
 
 
338 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  35.05 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  38.94 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  31.65 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.74 
 
 
303 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.57 
 
 
309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  32.65 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  34.72 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  37.09 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.81 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.49 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  36.45 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
303 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
255 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 
329 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  36.45 
 
 
282 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  38.03 
 
 
270 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  36.84 
 
 
302 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.68 
 
 
318 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  36.36 
 
 
302 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04340  ABC transporter related  32.59 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23580  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.63 
 
 
324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.57 
 
 
321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 
324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  34.11 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.54 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.54 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.38 
 
 
327 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 
331 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  37.67 
 
 
305 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  36.87 
 
 
310 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  37.38 
 
 
337 aa  128  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 
334 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  36.82 
 
 
326 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
310 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 
312 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0243  ABC transporter related  35.38 
 
 
232 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  33.95 
 
 
320 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  35.65 
 
 
237 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
318 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.62 
 
 
328 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  39.72 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
328 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  34.32 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>