More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1277 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1277  ABC transporter related  100 
 
 		 205 aa  430  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4277  ABC transporter related  44.39 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0483336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6496  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0021412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2685  ABC transporter related  43.2 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1035  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  37 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1569  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  30.26 
 
 		 256 aa  95.1  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2717  ABC transporter related  28.65 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  30.95 
 
 		 300 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  30.73 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  27.55 
 
 		 290 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  31.19 
 
 		 300 aa  91.3  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 310 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  31.68 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  35.8 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 		 300 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3616  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  32.12 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3903  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  32.12 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 		 300 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  29.9 
 
 		 311 aa  89  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0358  ABC transporter related  31.94 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1560  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.87 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0600798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 226 aa  87.8  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 309 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  29.65 
 
 		 301 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  30.46 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0053  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.633945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  29.86 
 
 		 323 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  35.26 
 
 		 249 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3979  ABC transporter related  29.32 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  31.93 
 
 		 322 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 303 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  28 
 
 		 306 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  30.81 
 
 		 305 aa  85.1  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0698  ABC transporter related  31.09 
 
 		 200 aa  84.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  27.75 
 
 		 299 aa  85.1  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  27.18 
 
 		 303 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  31.46 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  29.69 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  27.18 
 
 		 303 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  30.48 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  26.87 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4435  heme exporter protein CcmA  29.9 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  31.28 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  29.38 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  27.18 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0966  ABC transporter related  29.61 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  30 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03720  ABC transporter related  29.56 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  33.33 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  31.74 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08812  ABC transporter (Eurofung)  29.17 
 
 		 1626 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  28.65 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3424  ABC transporter-related protein  32.39 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  26.7 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3066  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2001  ABC transporter related  29.14 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03750  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.69 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.591537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.24 
 
 		 539 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.81 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.874439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  32.04 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1495  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.65 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.61 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0680  heme exporter protein CcmA  28.57 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  32.94 
 
 		 315 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  28.64 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  29.06 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  27.98 
 
 		 312 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  29.79 
 
 		 332 aa  81.3  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  31.75 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1617  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.54 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0182148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  31.25 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  30.59 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2001  ABC transporter related  31.76 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.985139  hitchhiker  0.00587688 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  33.74 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  27.13 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  28.72 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>