More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3066 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3066  ABC transporter related protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2922  ABC transporter related  72.2 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 305 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  42.62 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 305 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  43.95 
 
 		 305 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 305 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 305 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 305 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 304 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  46.19 
 
 		 304 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  46.43 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 311 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  45.28 
 
 		 306 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  43.24 
 
 		 303 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  43.24 
 
 		 303 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.24 
 
 		 331 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  43.24 
 
 		 331 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  43.87 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  42.92 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  43.38 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  43.38 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  42.45 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.49 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  44.34 
 
 		 307 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 307 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  43.6 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  41.4 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.09 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  44.62 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 312 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 300 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  45.54 
 
 		 301 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  41.55 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 309 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  41.94 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 306 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 309 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 310 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  43.13 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 302 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  41.78 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 309 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 309 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 309 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  41.41 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 309 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.92 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  41.51 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  42.45 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2202  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 310 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  41.55 
 
 		 435 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40.58 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 299 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 356 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 		 327 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  43.69 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  39.09 
 
 		 322 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0359  ABC transporter related  38.89 
 
 		 306 aa  168  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.3561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.63 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  41.15 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  37.3 
 
 		 876 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  40.19 
 
 		 314 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>