More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2290 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  55.29 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  49.76 
 
 		 217 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  49.28 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3979  ABC transporter related  47.37 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0363  ABC transporter related  45.19 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0053  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.633945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1569  ABC transporter related protein  46 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 304 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  38.14 
 
 		 303 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 331 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.14 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  38.14 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  38.14 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.77 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.77 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 305 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  37.21 
 
 		 303 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  37.39 
 
 		 303 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  40.67 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  38.92 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  40.09 
 
 		 300 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  151  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  151  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  37.38 
 
 		 304 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2021  ABC transporter related  36.96 
 
 		 290 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1988  ABC transporter related  36.96 
 
 		 290 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.854169  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  38.38 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 309 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 976 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 309 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2286  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.85 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0840896  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  35.41 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 309 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 309 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 309 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.5 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  35.85 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0359  ABC transporter related  37.39 
 
 		 306 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.3561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  41.97 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  42.7 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.4 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 346 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.01 
 
 		 339 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  36.36 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1475  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000651776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  34.56 
 
 		 409 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 496 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  33.68 
 
 		 287 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  32.84 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  34.15 
 
 		 457 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  38.32 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  33.82 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 303 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.66 
 
 		 944 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1811  ABC transporter related  34.42 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 311 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  34.65 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  33.01 
 
 		 300 aa  131  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 868 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  33.17 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.35 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  33.48 
 
 		 316 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  30.58 
 
 		 302 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  32.69 
 
 		 308 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  34.55 
 
 		 897 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  33.65 
 
 		 346 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.52 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>