More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0053 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0053  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.633945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3979  ABC transporter related  56.31 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  55.88 
 
 
218 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  50.72 
 
 
217 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1165  ABC transporter related protein  51.22 
 
 
216 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1569  ABC transporter related protein  50.51 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  48.08 
 
 
226 aa  191  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0363  ABC transporter related  43.13 
 
 
219 aa  189  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
300 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 
300 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 
300 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
300 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  40.78 
 
 
305 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  42.45 
 
 
300 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  41.51 
 
 
300 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  41.23 
 
 
299 aa  158  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
300 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
310 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
300 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  41.51 
 
 
300 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.29 
 
 
214 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  37.38 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  40.89 
 
 
302 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  36.59 
 
 
323 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
305 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
305 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
305 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  39.42 
 
 
305 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
305 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
305 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
309 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
305 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
305 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
309 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
305 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  40.67 
 
 
297 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
305 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
309 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
309 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
305 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  39.34 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
309 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
309 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 
307 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  39.51 
 
 
303 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
309 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
299 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  36.97 
 
 
305 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 
318 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
331 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  40.19 
 
 
307 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  35.58 
 
 
304 aa  144  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0359  ABC transporter related  41.18 
 
 
306 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.3561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
312 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
301 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  35.98 
 
 
304 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.13 
 
 
303 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  39.42 
 
 
301 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  35.64 
 
 
316 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
302 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.13 
 
 
303 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.96 
 
 
331 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.96 
 
 
331 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
307 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 
268 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
307 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
307 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  37.31 
 
 
320 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
307 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
307 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  38.94 
 
 
307 aa  141  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.47 
 
 
303 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  37.14 
 
 
304 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  37.09 
 
 
306 aa  141  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  32.86 
 
 
311 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
307 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
307 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  33.98 
 
 
297 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  35.58 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.65 
 
 
303 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
307 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.17 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.19 
 
 
299 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  37.56 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  36.74 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
304 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
346 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  35.89 
 
 
236 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  36.23 
 
 
302 aa  138  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03750  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.62 
 
 
237 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.591537  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  37.5 
 
 
307 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.33 
 
 
292 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  38.94 
 
 
306 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3616  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 
234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3903  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 
234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>