More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4435 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4435  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  85.02 
 
 
211 aa  360  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  60.59 
 
 
204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2717  ABC transporter related  42.86 
 
 
236 aa  174  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  43.75 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.79 
 
 
312 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.24 
 
 
312 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  36.65 
 
 
302 aa  121  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  39.36 
 
 
325 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.98 
 
 
317 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.71 
 
 
319 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  34.83 
 
 
266 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
302 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  34.17 
 
 
325 aa  117  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  35.52 
 
 
327 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  36.02 
 
 
287 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05000  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.13 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.977255  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.46 
 
 
309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  36.17 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  36.17 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  33.96 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  41.76 
 
 
226 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.07 
 
 
249 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.85 
 
 
310 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 
339 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  33.33 
 
 
218 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  33.5 
 
 
257 aa  111  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 
330 aa  111  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.68 
 
 
312 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  39.58 
 
 
249 aa  111  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  35.23 
 
 
348 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
312 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  35.23 
 
 
348 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07660  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.84 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.771669  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
312 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 
332 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 
316 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.65 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 
323 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  34.66 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  34.08 
 
 
344 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
305 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  33.5 
 
 
304 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.3 
 
 
247 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
312 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  34.04 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.17 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  30.15 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  30.54 
 
 
255 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2582  ABC transporter related  35.71 
 
 
237 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  33.15 
 
 
252 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
318 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  32.98 
 
 
339 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
311 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.2 
 
 
282 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  32.98 
 
 
339 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  33.85 
 
 
319 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  33.51 
 
 
337 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  31.84 
 
 
257 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  33.69 
 
 
338 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  30.3 
 
 
205 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  32.46 
 
 
303 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  34.17 
 
 
242 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  31.05 
 
 
244 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  34.64 
 
 
300 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
247 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  31.96 
 
 
318 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
311 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.74 
 
 
318 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.79 
 
 
239 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1476  ATPase  33 
 
 
215 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0027067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  33.86 
 
 
303 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1604  ABC transporter related  36.07 
 
 
245 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  34.2 
 
 
314 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0363  ABC transporter related  31.9 
 
 
219 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  34.91 
 
 
325 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  37.62 
 
 
409 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  34.21 
 
 
304 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  33.85 
 
 
306 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  35.18 
 
 
252 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 
309 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  36.27 
 
 
236 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5550  ABC transporter related  30.6 
 
 
231 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149026  hitchhiker  0.000395004 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
248 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1153  ABC transporter related  34.9 
 
 
206 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  30.69 
 
 
231 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  31.28 
 
 
310 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.2 
 
 
321 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.33 
 
 
302 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 
312 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>