More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1604 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1604  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1479  ABC transporter related  62.23 
 
 
258 aa  298  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1519  ABC transporter related  62.23 
 
 
258 aa  298  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.27 
 
 
309 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.51 
 
 
259 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
311 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  34.2 
 
 
314 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.02 
 
 
329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.85 
 
 
334 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.85 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.14 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.21 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.17 
 
 
279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  37.3 
 
 
325 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  39.44 
 
 
320 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.49 
 
 
328 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  35.58 
 
 
328 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 
327 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.07 
 
 
327 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  36.02 
 
 
312 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  36.51 
 
 
337 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  35 
 
 
275 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.66 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  38.34 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.05 
 
 
322 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  42.7 
 
 
259 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
247 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
256 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.96 
 
 
321 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 
316 aa  139  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
317 aa  139  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.97 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  32.62 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 
351 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  33.64 
 
 
305 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
312 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
312 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.16 
 
 
317 aa  138  7e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
312 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  38.76 
 
 
306 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.94 
 
 
312 aa  138  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
312 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  30.17 
 
 
270 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
312 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.38 
 
 
314 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  34.57 
 
 
266 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  32.84 
 
 
314 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  37.85 
 
 
344 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
541 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 
338 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.05 
 
 
308 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.21 
 
 
312 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.21 
 
 
246 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  38.83 
 
 
665 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.91 
 
 
247 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  32.52 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.31 
 
 
334 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.13 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
312 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 
317 aa  136  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.02 
 
 
328 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  32.7 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.06 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 
330 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.62 
 
 
316 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  36.45 
 
 
250 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  32.54 
 
 
322 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.24 
 
 
339 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.89 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  32.08 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.24 
 
 
339 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.48 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  30.93 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  30.45 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  32.06 
 
 
318 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  34.54 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  36.67 
 
 
317 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  31.03 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.44 
 
 
303 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  32.7 
 
 
314 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.92 
 
 
305 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  30.37 
 
 
316 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  33.64 
 
 
305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>