More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1519 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1519  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1479  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1604  ABC transporter related  62.23 
 
 
245 aa  298  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.93 
 
 
309 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  39.38 
 
 
325 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  33.2 
 
 
314 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.06 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  34.43 
 
 
241 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  32.16 
 
 
259 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  31.84 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.5 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 
323 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  35.27 
 
 
305 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.95 
 
 
312 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
311 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.58 
 
 
309 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 
279 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
304 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  36.7 
 
 
320 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 
259 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 
576 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  30.77 
 
 
306 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  37.21 
 
 
305 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  33.48 
 
 
588 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.04 
 
 
329 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  31.22 
 
 
257 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.94 
 
 
321 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  41.1 
 
 
304 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.5 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  35.23 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
350 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  29.46 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  31.71 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  40 
 
 
334 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  33.68 
 
 
580 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.08 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  30.65 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.75 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 
295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
580 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.15 
 
 
321 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  33.33 
 
 
243 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  33.01 
 
 
314 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
307 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
285 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.98 
 
 
351 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 
310 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
301 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.68 
 
 
578 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
371 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 
334 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  32.61 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  33.68 
 
 
578 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
578 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  34.2 
 
 
579 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  37.26 
 
 
303 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  32.88 
 
 
247 aa  131  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  34.72 
 
 
590 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  36.61 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.19 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.18 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.61 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 
578 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  32.82 
 
 
581 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  33.49 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 
578 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
578 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.8 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 
578 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  34.27 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  35.71 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  34.91 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  34.51 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  34.2 
 
 
590 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
585 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 
541 aa  130  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  35.6 
 
 
296 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  33.33 
 
 
252 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  28 
 
 
582 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 
578 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.77 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  37.11 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.63 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.34 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  32.61 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.34 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>