More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1411 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  44.27 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  44.79 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2717  ABC transporter related  44.15 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4435  heme exporter protein CcmA  43.75 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0680  heme exporter protein CcmA  41.49 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.78 
 
 		 312 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4277  ABC transporter related  39 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0483336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  38.54 
 
 		 305 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2685  ABC transporter related  33.97 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1277  ABC transporter related  37 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 309 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  36.36 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  35.64 
 
 		 348 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  35.64 
 
 		 348 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  35.64 
 
 		 348 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  41.62 
 
 		 304 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40 
 
 		 308 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  40.96 
 
 		 302 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2367  heme exporter protein CcmA  41.49 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  35.79 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.76 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  37.13 
 
 		 238 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 317 aa  118  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 241 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 241 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 242 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  33.68 
 
 		 255 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05000  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.61 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.977255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  40.21 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  36.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 		 332 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  35.92 
 
 		 300 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.04 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  38.1 
 
 		 331 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  38.78 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.07 
 
 		 304 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  38.78 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  37.43 
 
 		 350 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  35.38 
 
 		 314 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  35.9 
 
 		 304 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.91 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  38.31 
 
 		 382 aa  114  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.55 
 
 		 312 aa  114  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0916  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0694258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.35 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  31.98 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  35.53 
 
 		 575 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  38.12 
 
 		 366 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  36.55 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  39.58 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.76 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.06 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  36.04 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.06 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  35.18 
 
 		 284 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  27.6 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  37.37 
 
 		 291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  34.2 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.06 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.76 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  36.5 
 
 		 313 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07660  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.89 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.771669  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.21 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.14 
 
 		 324 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.36 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.05 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2582  ABC transporter related  35.68 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  38.66 
 
 		 310 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  38.38 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.25 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.28 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  33.5 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.41 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  32.35 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6496  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0021412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1811  ABC transporter related  36.36 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  32.63 
 
 		 344 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.1 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  35.53 
 
 		 323 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.41 
 
 		 342 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  34.17 
 
 		 308 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  40.91 
 
 		 261 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  35.53 
 
 		 323 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>