More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6496 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6496  ABC transporter related protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0021412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2685  ABC transporter related  51.94 
 
 		 206 aa  230  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4277  ABC transporter related  44.39 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0483336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1277  ABC transporter related  42.93 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1035  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  32.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  29.77 
 
 		 300 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  32.8 
 
 		 341 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 310 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1302  ABC transporter related  31.25 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  27.94 
 
 		 317 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  31.64 
 
 		 332 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 300 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 300 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  28.78 
 
 		 305 aa  90.9  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.04 
 
 		 337 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.18 
 
 		 307 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1153  ABC transporter related  30.41 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  33.51 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1495  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.36 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  32.43 
 
 		 322 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  30.37 
 
 		 309 aa  89.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 		 300 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  28.99 
 
 		 317 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  27.91 
 
 		 300 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  26.92 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3015  ABC transporter related  30.34 
 
 		 257 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137767 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  35.71 
 
 		 301 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.39 
 
 		 345 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  30.89 
 
 		 326 aa  88.2  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  27.86 
 
 		 337 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  28.65 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  28.02 
 
 		 315 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  27.67 
 
 		 290 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  30.73 
 
 		 302 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  31.22 
 
 		 302 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.9 
 
 		 369 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  30.73 
 
 		 409 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  29.27 
 
 		 301 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.17 
 
 		 309 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  29.31 
 
 		 309 aa  86.3  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  30.43 
 
 		 313 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  27.42 
 
 		 312 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  28.87 
 
 		 304 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  30 
 
 		 302 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  30.24 
 
 		 302 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  31.43 
 
 		 310 aa  85.5  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 241 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  27.05 
 
 		 311 aa  85.1  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  31.67 
 
 		 319 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4675  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.3 
 
 		 399 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  29.7 
 
 		 336 aa  85.5  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  29.74 
 
 		 312 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  33.54 
 
 		 241 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  26.6 
 
 		 305 aa  84.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 309 aa  84.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.85 
 
 		 335 aa  84.7  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  29.59 
 
 		 319 aa  84.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.27 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  28.92 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  28.36 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.28 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  32.7 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  28.5 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  30.51 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  27.54 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  31.52 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  29.84 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  30.41 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  26.92 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  28.23 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.88 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  33.56 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  27.45 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1033  ABC transporter related  29.21 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.107765 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  30.69 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  27.78 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0462  ABC transporter related  28.42 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  30.51 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  27.89 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  28.22 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.8 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0053  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.633945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  27.18 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  29.03 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2152  ABC transporter related  32.34 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0359  ABC transporter related  29.73 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.3561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>