More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1302 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1302  ABC transporter related  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1153  ABC transporter related  97.57 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  42.35 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  42.71 
 
 		 308 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  39.2 
 
 		 304 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  39.2 
 
 		 304 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  38.69 
 
 		 304 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  39.9 
 
 		 260 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  38.73 
 
 		 345 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.63 
 
 		 326 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.69 
 
 		 304 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.14 
 
 		 320 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.63 
 
 		 304 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  35 
 
 		 321 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.63 
 
 		 373 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  38.69 
 
 		 322 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35 
 
 		 313 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 306 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 351 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  38.19 
 
 		 344 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  39.2 
 
 		 306 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 351 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  41.79 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  40.7 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  35 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  38 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.19 
 
 		 304 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  37.69 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  37.93 
 
 		 317 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  36.32 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  34.5 
 
 		 308 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  37.63 
 
 		 316 aa  134  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  34.5 
 
 		 320 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0676  ABC transporter related  37.69 
 
 		 298 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.620401  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  39.3 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37 
 
 		 309 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  36.87 
 
 		 331 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  36 
 
 		 314 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.18 
 
 		 319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37 
 
 		 369 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  38.5 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 		 337 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.85 
 
 		 325 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 1171 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  38.5 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  38.5 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  35.47 
 
 		 311 aa  131  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 360 aa  131  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  37.69 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 309 aa  131  6e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  32.16 
 
 		 310 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.71 
 
 		 298 aa  131  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  36.68 
 
 		 304 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.68 
 
 		 293 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.5 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34 
 
 		 315 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.19 
 
 		 301 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  34.34 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  38.92 
 
 		 304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  35.5 
 
 		 315 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  38.89 
 
 		 323 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  36.45 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  37.88 
 
 		 309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  38.38 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  36 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  34.83 
 
 		 326 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  33 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  35.38 
 
 		 275 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  36.87 
 
 		 301 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.18 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  35.5 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  36 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  33.84 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  38.42 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  33 
 
 		 316 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  36.08 
 
 		 306 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 		 446 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 309 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 309 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 334 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  34.83 
 
 		 339 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  35.5 
 
 		 322 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  33.85 
 
 		 327 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  30.43 
 
 		 302 aa  128  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 334 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.04 
 
 		 316 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  35.6 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.5 
 
 		 312 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  33.67 
 
 		 309 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>