More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1205 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  40 
 
 
256 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1302  ABC transporter related  35.38 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.2 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  35.29 
 
 
234 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.27 
 
 
297 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1153  ABC transporter related  34.34 
 
 
206 aa  125  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 
356 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 
308 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  29.07 
 
 
246 aa  125  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  33.84 
 
 
249 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
294 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  31.2 
 
 
349 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  29.68 
 
 
338 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  33.62 
 
 
356 aa  122  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  29.68 
 
 
338 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  30.95 
 
 
243 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  29.88 
 
 
247 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  30.18 
 
 
342 aa  122  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  29.65 
 
 
338 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  30.77 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  30.17 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  36.76 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  31.56 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  30.77 
 
 
349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  30.95 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  30.77 
 
 
349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  31.39 
 
 
306 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  29.17 
 
 
350 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  30.57 
 
 
304 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.7 
 
 
308 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  29.05 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 
329 aa  119  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.91 
 
 
334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  27.2 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  28.43 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 
304 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
306 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
217 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  30.99 
 
 
244 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  30.99 
 
 
244 aa  118  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  26.63 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.2 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  30.51 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1418  ABC transporter related  29.65 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  27.39 
 
 
297 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  28.02 
 
 
314 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.48 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30.32 
 
 
283 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.87 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.49 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  33.33 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  28.18 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  31.76 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.3 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  30.77 
 
 
379 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  29.31 
 
 
346 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  32.41 
 
 
272 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  32.41 
 
 
272 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3262  ABC transporter related  29.02 
 
 
320 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  29.22 
 
 
338 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  34.38 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  35.65 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  31.86 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1454  ABC transporter related  32.27 
 
 
238 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  30.3 
 
 
355 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.98 
 
 
357 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4875  ABC transporter related  30.05 
 
 
279 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  27.84 
 
 
314 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  28.22 
 
 
260 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  28.4 
 
 
382 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
306 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  26.96 
 
 
241 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  33.03 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.77 
 
 
354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  33.03 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
541 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  30.3 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.48 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  34.11 
 
 
233 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
352 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  28.83 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  27.8 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  32.86 
 
 
219 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.48 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  29.51 
 
 
580 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  30 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  31.36 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  31.14 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>