More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1035 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1035  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6496  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0021412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1277  ABC transporter related  45.37 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4277  ABC transporter related  44.12 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0483336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2685  ABC transporter related  41.95 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2543  heme exporter protein CcmA  31.03 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  27.32 
 
 		 296 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0753  heme exporter protein CcmA  29.56 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.054647  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  32.69 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.29 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  29.71 
 
 		 325 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  28.34 
 
 		 308 aa  98.2  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  31.22 
 
 		 317 aa  97.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4435  heme exporter protein CcmA  28.57 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2717  ABC transporter related  27.72 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  30.39 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  29.21 
 
 		 327 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2152  ABC transporter related  29.21 
 
 		 302 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.77 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  30.35 
 
 		 290 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 308 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  31.07 
 
 		 316 aa  93.2  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1302  ABC transporter related  31.87 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  28.36 
 
 		 301 aa  92.8  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1153  ABC transporter related  32.79 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  31.58 
 
 		 316 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  30.27 
 
 		 249 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.55 
 
 		 310 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  30.05 
 
 		 311 aa  91.7  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  32.04 
 
 		 315 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  32.98 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.73 
 
 		 325 aa  91.7  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  31.58 
 
 		 302 aa  91.3  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  28.02 
 
 		 338 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0680  heme exporter protein CcmA  29.57 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.87 
 
 		 317 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1495  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.5 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  30.61 
 
 		 308 aa  89.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  25.36 
 
 		 286 aa  89.7  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.78 
 
 		 316 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5550  ABC transporter related  28.99 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149026  hitchhiker  0.000395004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  31.61 
 
 		 320 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  31.44 
 
 		 300 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 301 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  31.61 
 
 		 320 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.65 
 
 		 318 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 302 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 301 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 302 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.4 
 
 		 316 aa  89  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1932  ABC transporter related  31.82 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  28.93 
 
 		 305 aa  88.6  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  30.73 
 
 		 344 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.13 
 
 		 337 aa  88.2  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  29.1 
 
 		 283 aa  88.6  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.26 
 
 		 298 aa  87.8  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  30.27 
 
 		 344 aa  87.8  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  28.95 
 
 		 305 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  27.27 
 
 		 309 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  31.07 
 
 		 319 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  29.82 
 
 		 309 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  27.98 
 
 		 284 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.76 
 
 		 323 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.8 
 
 		 309 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  27.75 
 
 		 322 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  32.76 
 
 		 309 aa  87  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0236  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  27.54 
 
 		 329 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  29.13 
 
 		 266 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  28.37 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  28.85 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  26.2 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 408 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  30.93 
 
 		 305 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0823  ABC transporter, transmembrane region, type 1  29.21 
 
 		 558 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  30.57 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  26.63 
 
 		 302 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  26.74 
 
 		 300 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  30.57 
 
 		 304 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  28.78 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  28.42 
 
 		 303 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  28.81 
 
 		 316 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  30.43 
 
 		 240 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  28.78 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  27.32 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  28.02 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 300 aa  85.5  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0792  ABC transporter related  27.92 
 
 		 325 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  29.14 
 
 		 252 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  26.96 
 
 		 341 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  34.21 
 
 		 304 aa  85.1  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  28.5 
 
 		 305 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  25.74 
 
 		 316 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  29.21 
 
 		 299 aa  84.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.72 
 
 		 339 aa  84.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3424  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 		 297 aa  84.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  28.43 
 
 		 301 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 		 309 aa  84.7  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  31.61 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>